理事机构包括以下机构:泛美卫生会议, 指导委员会, 及执行委员会. 执行委员会的辅助咨询机构是计划小组委员会, 预算, 和管理.
泛美卫生会议
会议是本组织的最高管理机构，每五年举行一次会议，确定本组织的一般政策.
指导委员会
理事会通常应在会议不举行会议的年份每年举行一次会议. 它在届会之间代表减灾会议采取行动.
执行委员会
执行委员会由本组织九个会员国组成, 由大会或理事会选举产生，任期三年. 该委员会每年举行两次会议，作为会议或理事会的工作组. 特别会议由主席团主任主动召开，或应至少三个会员国的要求召开. 该委员会设有一个辅助咨询机构, 计划小组委员会, 预算, 和管理.
计划、预算和行政小组委员会
计划小组委员会, 预算和行政是执行委员会的一个辅助咨询机构，负责项目的各个方面, 预算及行政. 它审查这些领域，并酌情向执行委员会提出建议. 小组委员会由七名成员组成, 其中四名成员的任期与执行委员会成员的任期同时，另外三人由泛美卫生局局长与执行委员会总统协商后每年指定，以寻求均衡和适当的地域分配. 小组委员会每年至少举行一次公开会议，日期由执行委员会决定. 在审议本组织计划预算的年份，可召开额外会议.
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